Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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