Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnpP16330 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnpP16330 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnpP16330 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms