Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms