Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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