Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms