Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms