Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01788 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01788 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01788 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01788 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01788 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01788 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01788 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms