Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01787 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01787 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01787 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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