Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01739 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01739 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01739 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms