Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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