Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn5O54942 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn5O54942 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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