Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek2O35942 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek2O35942 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms