Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2bO35690 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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