Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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