Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ColqO35348 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ColqO35348 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ColqO35348 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ColqO35348 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ColqO35348 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ColqO35348 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms