Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms