Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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