Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm17078M0QW51 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm17078M0QW51 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms