Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21310J3QQ23 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms