Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms