Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms