Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms