Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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