Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms