Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef1G3X9K3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms