Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms