Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms