Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8247F6VRJ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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