Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms