Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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