Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms