Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC035044E0CXF8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms