Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms