Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms