Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms