Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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