Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce3B5KM66 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms