Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms