Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprbB2RU80 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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