Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NhsB1AV60 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms