Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprsB0V2N1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprsB0V2N1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms