Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms