Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm5640A3KG49 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm5640A3KG49 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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