Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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