Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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