Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms