Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd1A2AKB4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms