Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdfS4R2K0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdfS4R2K0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms