Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd1Q9Z2E2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms