Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms